产品介绍
Illumina公司在延续450K基于单核苷酸分辨率检测优势的基础上，全新推出升级版人类全基因组甲基化芯片—Infinium® MethylationEPIC BeadChip。该芯片覆盖大于850,000个CpGs区域，跨越人类全部甲基化组。可对包括FFPE样本在内的多种类型样本进行甲基化检测，真正做到了高通量、低成本。Infinium® MethylationEPIC BeadChip以其更全面的覆盖以及高通量的样本检测能力，成为新一季表观基因组关联研究（EWAS）的理想研究工具。
技术优势
1.全基因组覆盖（>850,000个甲基化位点）
CpG 岛 非CpG岛
FANTOM5增强子
ENCODE开放染色质及转录因子结合位点（增强子区域）miRNA启动子区
2.良好的技术重复性
98%技术重复性
与450K结果的一致性极佳（r> 0.98）
涵盖90% 450K芯片上的CpG位点
3.首款可对FFPE样本进行检测的甲基化芯片
4.精确度高
目标区域富集、测序深度分布、覆盖度的重复性高；优先选用AgilentSureSelectXT Human Methyl-Seq 捕获探针，目标区域包括:
① 目标区域为84M，检测3.7M的CpG位点；
② 主要针对CpG island、Gencode promoter和已知调控区域；
③ 覆盖已知的癌症特异DMR区域和组织特异性DMR区域；
④ 包含CpG 岛上下游 4kb范围的“shores”和“shelves”区域；
⑤ 包含脱氧核糖核酸酶I（DNase I）高敏感性位点。也可以采用全基因组编码基因启动子芯片（TSS上游2k，下游500bp，NimbleGene 芯片）。
实验策略
技术参数
| 样本要求 | 项目周期 |
| 1. 样品纯度：OD 260/280值应在1.8～2.0 之间；RNA 应该去除干净； 不得有其它个体或其它物种的DNA污染。 2. 样品浓度：浓度不低于55ng/μl。 3. 样品总量：每个样品总量不少于2μg 。 | 40个工作日 |
案例分析
案例：全基因组甲基化测序分析年龄与DNA甲基化的关系
Heyn H, Li N, Ferreira HJ, et al. Distinct DNA methylomes of newborns and centenarians. Proc Natl Acad Sci USA. 2012 Jun 26;109(26):10522-7.）
背景：
人类的寿命不仅仅由遗传决定，环境因素可以通过改变表观遗传修饰对衰老的过程产生不可忽视的影响。文章通过WGBS技术比较了一位103岁老年男子和一名新生男婴的DNA样本，并在更大样本量中进行了甲基化芯片验证。
方法：
健康老人（Y103）的外周血和新生儿（NB）脐带血，分别提取RNA和DNA，血液分别提取RNA和DNA，DNA进行打断、Bisulfite处理建库，然后进行测序，最后用大样本量甲基化芯片验证。
结论：
最终发现与同样的细胞类型的新生儿相比，整体上百岁老人DNA中有更多的非甲基化位点。
百岁老人（红色）与新生儿（蓝色）的甲基化分布
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