产品介绍
全基因组羟甲基化DNA免疫共沉淀测序（Hydroxymethylated DNA
Immunoprecipitation Sequencing，hMeDIP-Seq）通过运用5′-羟甲基胞嘧啶特异性抗体富集羟甲基化的DNA片段，然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量，快速、高效地寻找羟甲基化区域。可广泛应用于羟甲基化与疾病关系研究以及羟甲基化在胚胎发育过程中的研究。
技术优势
1.运用范围广
适用于人和大多数动植物
2.全基因组覆盖
最大限度地获取完整的全基因组甲基化信息，精确绘制甲基化图谱
3.单碱基分辨率
可精确分析每一个C碱基的甲基化状态
实验策略
信息分析
技术参数
| 样本要求 | 项目周期 |
| 总量：不同样本需求不同，人类样本≥ 2μg；纯度： OD260/280 = 1.8~2.0；完整性：DNA无明显降解，需提供凝胶电泳检测胶图。推荐数据量： 4G clean data | 15个样本以下标准流程的运转周期约为30个工作日。样品数较多时，项目周期需要与技术支持人员确定。 |
案例分析
案例：小鼠胚胎干细胞的羟甲基化研究
Wu H, et al. Genome-wide analysis of 5-hydroxymethylcytosine distribution reveals its dual function in transcriptional regulation in mouse embryonic stem cells. Genes Dev. 2011 Apr 1;25(7):679-84.
背景：
研究证实TET家族蛋白可以催化5mC转化为5hmC。5mC已经被广泛研究，但对5hmC的分布和功能知道的还很少。
方法：
利用hMeDIP-seq测序技术对小鼠胚胎干细胞的wild-type和Tet1-depleted type的5hmC进行研究。
结论：
5hmC在转录活性高的基因的gene bodies区域和受到Polycomb抑制的发育调节因子的启动子区域；5hmC可能在基因表达调控中起着激活和抑制的双重功能。
5hmC在全基因组的分布
