全基因组甲基化免疫共沉淀测序(MeDIP-Seq)

Clear laboratory test tubes with blue caps arranged on a blue background.

产品介绍

甲基化DNA免疫沉淀测序(Methylated DNA Immunoprecipitation  Sequencing,MeDIP-Seq)通过运用5′- 甲基胞嘧啶特异性抗体富集甲基化的DNA片段,然后结合高通量测序技术在全基因组水平上以较小的数据量,快速、 高效地寻找甲基化区域,从而比较不同细胞、组织等样品间的DNA甲基化差异。可广泛用于大样本量的疾病研究和分子育种研究。

技术优势

1.检测范围广

全基因组范围鉴定甲基化修饰区域

2.针对性强

针对性检测基因组内具有甲基化修饰的区域

3.成本低

大大降低了测序数据量,测序成本低

实验策略

信息分析

技术参数

样本要求项目周期
总量:不同样本需求不同,人类样本≥ 2μg;纯度: OD260/280 = 1.8~2.0;完整性:DNA无明显降解,需提供凝胶电泳检测胶图。推荐数据量: 4G clean data15个样本以下标准流程的运转周期约为30个工作日。样品数较多时,项目周期需要与技术支持人员确定。

案例分析

案例:猪脂肪和肌肉组织的甲基化组

Li, M. et al.An atlas of DNA methylomes in porcine adipose and muscle tissues. Nat. Commun. 3:850 doi: 10.1038/ncomms 1854 (2012).

背景

研究表明表观修饰因子,特别是DNA甲基化在肥胖发生的过程中发挥重要的作用。猪作为重要的动物模型,有助于研究人的代谢和肥胖。

方法

利用MeDIP-seq测序技术对来自于3种猪的8个脂组织和2个肌肉组织,共计180个样品进行甲基化修饰检测。系统性的研究DNA甲基化和肥胖之间的关系。

结论

构建了猪脂肪和肌肉的DNA甲基化图谱,鉴定了种间、性别和组织间的差异甲基化修饰区域(DMR),启动子区域的DMR通过抑制基因的表达与肥胖的发生有高度的相关性。

鉴定的差异甲基化修饰区域(DMR)

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